Protein–RNA interactions for Protein: P32240

Ptger4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptger4P32240 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptger4P32240 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptger4P32240 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms