Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HexaP29416 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HexaP29416 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HexaP29416 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HexaP29416 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HexaP29416 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HexaP29416 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HexaP29416 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HexaP29416 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HexaP29416 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HexaP29416 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HexaP29416 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HexaP29416 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HexaP29416 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HexaP29416 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HexaP29416 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HexaP29416 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HexaP29416 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HexaP29416 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HexaP29416 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HexaP29416 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HexaP29416 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HexaP29416 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
HexaP29416 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HexaP29416 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HexaP29416 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HexaP29416 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HexaP29416 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HexaP29416 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HexaP29416 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HexaP29416 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HexaP29416 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HexaP29416 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HexaP29416 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HexaP29416 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HexaP29416 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HexaP29416 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HexaP29416 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HexaP29416 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HexaP29416 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HexaP29416 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HexaP29416 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HexaP29416 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HexaP29416 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HexaP29416 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HexaP29416 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HexaP29416 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HexaP29416 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms