Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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