Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apex1P28352 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apex1P28352 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms