Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms