Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CftrP26361 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CftrP26361 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CftrP26361 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CftrP26361 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CftrP26361 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CftrP26361 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CftrP26361 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CftrP26361 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CftrP26361 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CftrP26361 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CftrP26361 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CftrP26361 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CftrP26361 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CftrP26361 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CftrP26361 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CftrP26361 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CftrP26361 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CftrP26361 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CftrP26361 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CftrP26361 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CftrP26361 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CftrP26361 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CftrP26361 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CftrP26361 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CftrP26361 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CftrP26361 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CftrP26361 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CftrP26361 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CftrP26361 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CftrP26361 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CftrP26361 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CftrP26361 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CftrP26361 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CftrP26361 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CftrP26361 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CftrP26361 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CftrP26361 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CftrP26361 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CftrP26361 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CftrP26361 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CftrP26361 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CftrP26361 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CftrP26361 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CftrP26361 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CftrP26361 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CftrP26361 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CftrP26361 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CftrP26361 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CftrP26361 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CftrP26361 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CftrP26361 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CftrP26361 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CftrP26361 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CftrP26361 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CftrP26361 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CftrP26361 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CftrP26361 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CftrP26361 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CftrP26361 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CftrP26361 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CftrP26361 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CftrP26361 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CftrP26361 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CftrP26361 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CftrP26361 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CftrP26361 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CftrP26361 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CftrP26361 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CftrP26361 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CftrP26361 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CftrP26361 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CftrP26361 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CftrP26361 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CftrP26361 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CftrP26361 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CftrP26361 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CftrP26361 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CftrP26361 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CftrP26361 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CftrP26361 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CftrP26361 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CftrP26361 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CftrP26361 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CftrP26361 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CftrP26361 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CftrP26361 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CftrP26361 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CftrP26361 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CftrP26361 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CftrP26361 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CftrP26361 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CftrP26361 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CftrP26361 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CftrP26361 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CftrP26361 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CftrP26361 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CftrP26361 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CftrP26361 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CftrP26361 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms