Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf1bP25119 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms