Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm29803-201ENSMUST00000205069 375 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 AC079245.1-201ENSMUST00000215680 1454 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Olfr452-201ENSMUST00000075468 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Zfp983-201ENSMUST00000039726 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm14021-201ENSMUST00000117683 961 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms