Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms