Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZfaP23607 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms