Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms