Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms