Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms