Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RarbP22605 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RarbP22605 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RarbP22605 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RarbP22605 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RarbP22605 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RarbP22605 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RarbP22605 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RarbP22605 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RarbP22605 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RarbP22605 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RarbP22605 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RarbP22605 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RarbP22605 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RarbP22605 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RarbP22605 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RarbP22605 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RarbP22605 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RarbP22605 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RarbP22605 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RarbP22605 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RarbP22605 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RarbP22605 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RarbP22605 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RarbP22605 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RarbP22605 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RarbP22605 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RarbP22605 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RarbP22605 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RarbP22605 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RarbP22605 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RarbP22605 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RarbP22605 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RarbP22605 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RarbP22605 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RarbP22605 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RarbP22605 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RarbP22605 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RarbP22605 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RarbP22605 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RarbP22605 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RarbP22605 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RarbP22605 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RarbP22605 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RarbP22605 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RarbP22605 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RarbP22605 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RarbP22605 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RarbP22605 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RarbP22605 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RarbP22605 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RarbP22605 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RarbP22605 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RarbP22605 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RarbP22605 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RarbP22605 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RarbP22605 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RarbP22605 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RarbP22605 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RarbP22605 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RarbP22605 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RarbP22605 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RarbP22605 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RarbP22605 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RarbP22605 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RarbP22605 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RarbP22605 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms