Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tap1P21958 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tap1P21958 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms