Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms