Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms