Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms