Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18525 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18525 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18525 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18525 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18525 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18525 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18525 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18525 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18525 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P18525 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18525 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P18525 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18525 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P18525 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18525 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P18525 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18525 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18525 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18525 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P18525 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18525 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18525 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms