Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms