Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou4f1P17208 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms