Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gabra6P16305 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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