Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Q9P14431 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q9P14431 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms