Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms