Protein–RNA interactions for Protein: P12961

Scg5, Neuroendocrine protein 7B2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg5P12961 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg5P12961 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg5P12961 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg5P12961 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg5P12961 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg5P12961 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg5P12961 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg5P12961 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg5P12961 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg5P12961 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg5P12961 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg5P12961 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg5P12961 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg5P12961 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg5P12961 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg5P12961 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg5P12961 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg5P12961 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg5P12961 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg5P12961 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg5P12961 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg5P12961 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg5P12961 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg5P12961 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms