Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtcP11725 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
OtcP11725 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtcP11725 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtcP11725 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtcP11725 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtcP11725 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtcP11725 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtcP11725 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtcP11725 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtcP11725 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtcP11725 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtcP11725 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtcP11725 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtcP11725 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtcP11725 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtcP11725 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtcP11725 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtcP11725 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtcP11725 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtcP11725 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtcP11725 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtcP11725 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtcP11725 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtcP11725 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtcP11725 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtcP11725 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
OtcP11725 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtcP11725 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
OtcP11725 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtcP11725 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtcP11725 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtcP11725 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtcP11725 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtcP11725 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
OtcP11725 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms