Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP11369 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP11369 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP11369 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PolP11369 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms