Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms