Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms