Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms