Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms