Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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