Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Egr1P08046 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Egr1P08046 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Egr1P08046 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Egr1P08046 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Egr1P08046 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Egr1P08046 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Egr1P08046 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms