Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TnfP06804 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TnfP06804 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TnfP06804 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnfP06804 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TnfP06804 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TnfP06804 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TnfP06804 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TnfP06804 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TnfP06804 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TnfP06804 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TnfP06804 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TnfP06804 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TnfP06804 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TnfP06804 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TnfP06804 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TnfP06804 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TnfP06804 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TnfP06804 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TnfP06804 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TnfP06804 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TnfP06804 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TnfP06804 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TnfP06804 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TnfP06804 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TnfP06804 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TnfP06804 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TnfP06804 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TnfP06804 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TnfP06804 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TnfP06804 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TnfP06804 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TnfP06804 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TnfP06804 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TnfP06804 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TnfP06804 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TnfP06804 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TnfP06804 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TnfP06804 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TnfP06804 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TnfP06804 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TnfP06804 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TnfP06804 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TnfP06804 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TnfP06804 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TnfP06804 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms