Protein–RNA interactions for Protein: P06796

Csn3, Kappa-casein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn3P06796 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Csn3P06796 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csn3P06796 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Csn3P06796 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms