Protein–RNA interactions for Protein: P06324

T-cell receptor gamma chain V region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06324 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06324 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06324 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06324 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06324 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06324 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06324 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06324 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P06324 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P06324 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06324 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06324 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06324 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06324 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06324 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06324 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06324 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06324 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06324 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06324 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06324 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06324 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06324 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06324 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06324 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06324 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06324 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06324 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06324 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06324 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06324 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06324 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06324 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06324 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P06324 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06324 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06324 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06324 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P06324 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06324 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06324 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06324 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06324 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06324 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06324 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06324 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms