Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01747 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01747 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01747 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01747 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01747 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01747 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01747 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01747 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01747 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01747 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01747 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01747 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01747 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01747 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01747 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01747 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01747 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01747 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01747 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01747 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms