Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01738 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01738 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
P01738 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms