Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01678 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01678 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01678 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01678 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01678 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01678 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01678 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01678 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01678 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01678 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01678 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01678 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01678 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01678 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01678 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01678 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01678 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01678 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01678 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01678 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01678 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01678 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01678 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01678 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01678 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01678 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01678 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01678 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01678 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms