Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp1O89090 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sp1O89090 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp1O89090 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sp1O89090 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sp1O89090 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sp1O89090 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp1O89090 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp1O89090 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sp1O89090 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sp1O89090 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sp1O89090 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sp1O89090 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp1O89090 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms