Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShdO88834 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShdO88834 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShdO88834 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ShdO88834 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ShdO88834 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ShdO88834 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ShdO88834 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms