Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BlmO88700 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BlmO88700 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BlmO88700 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BlmO88700 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BlmO88700 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BlmO88700 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BlmO88700 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BlmO88700 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BlmO88700 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BlmO88700 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BlmO88700 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BlmO88700 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BlmO88700 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BlmO88700 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BlmO88700 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BlmO88700 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BlmO88700 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BlmO88700 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BlmO88700 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BlmO88700 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BlmO88700 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BlmO88700 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BlmO88700 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BlmO88700 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BlmO88700 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BlmO88700 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BlmO88700 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BlmO88700 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BlmO88700 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BlmO88700 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BlmO88700 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BlmO88700 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BlmO88700 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BlmO88700 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
BlmO88700 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
BlmO88700 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
BlmO88700 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BlmO88700 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BlmO88700 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BlmO88700 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BlmO88700 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BlmO88700 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BlmO88700 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BlmO88700 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BlmO88700 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BlmO88700 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BlmO88700 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BlmO88700 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BlmO88700 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BlmO88700 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BlmO88700 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BlmO88700 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BlmO88700 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BlmO88700 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BlmO88700 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BlmO88700 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BlmO88700 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BlmO88700 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BlmO88700 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BlmO88700 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BlmO88700 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BlmO88700 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BlmO88700 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BlmO88700 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BlmO88700 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BlmO88700 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BlmO88700 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BlmO88700 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BlmO88700 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BlmO88700 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BlmO88700 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BlmO88700 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BlmO88700 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BlmO88700 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BlmO88700 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BlmO88700 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BlmO88700 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BlmO88700 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BlmO88700 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BlmO88700 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BlmO88700 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BlmO88700 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BlmO88700 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BlmO88700 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BlmO88700 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BlmO88700 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BlmO88700 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BlmO88700 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BlmO88700 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BlmO88700 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BlmO88700 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BlmO88700 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BlmO88700 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BlmO88700 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BlmO88700 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BlmO88700 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BlmO88700 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BlmO88700 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BlmO88700 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms