Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp2O88623 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp2O88623 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp2O88623 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp2O88623 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp2O88623 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp2O88623 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp2O88623 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp2O88623 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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