Protein–RNA interactions for Protein: O88532

Zfr, Zinc finger RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfrO88532 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZfrO88532 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZfrO88532 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZfrO88532 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZfrO88532 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZfrO88532 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZfrO88532 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZfrO88532 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms