Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms