Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm10509O88255 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm10509O88255 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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