Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1O70583 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1O70583 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1O70583 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms