Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp4O70480 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vamp4O70480 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms