Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb5O70309 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms