Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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